沼气发电是一个系统工程，它包括沼气生产、沼气净化与储存、沼气发电及上网等多项单元技术的优化组合，下面是沼气发电机组系统配置参照：
（1）根据沼气产量选择合适的装机容量，避免设备闲置或沼气浪费；
（2）沼气机组市场占有率很高，性价比也是较高的，维护、维修、保养费用比较低；
（3）多台机组时，宜选用1000KW左右的同一规格，以降低运行费用和备件储存。在台数较少时，选择一台功率较小的。比如一台1000KW加一台500KW，便于在气量变化较大时调节输出功率，保证机组在70%以上的功率下输出；
（4）发电效率高意味着在消耗相同的燃气时能发出更多的电；
（5）在线率高意味着停机时间少，浪费的沼气少，发电量多；
（6）气体纯净时，或者气体处理得当时，机组一个大修期可达50000～60000小时，一般可达30000～40000小时。但有些机组只达10000～20000小时；
（7）沼气中含有微量的腐蚀性成分，对机油造成污染，其消耗量比使用天然气时要大，机油是一种主要的消耗品，在运行成本中占有一定份额。而不同品牌机组的机油耗量差异较大；
（8）零配件价格有数倍之差，特别注意耗材，比如火花塞价格。直接关系到运行费用；
（9）齐全的零配件储备可大大缩短停机时间，增加发电量；
（10）维修队伍能否短时间到达现场，对保证运行时间至关重要；
（11）机组是一种大型贵重设备，应着重于长远的综合评估。综合性价比比价格更重要。
